继而将太后阎姬迁到离宫居住，其家属全部发配到边疆比景县；阎氏外戚全部伏诛后，刘保才下令打开宫门，撤回屯兵。继而对司隶校尉下诏说：“只有阎显、江京的近亲伏诛即刻，其余人都务从宽恕。”随后，刘保先后拜谒汉高帝宗庙与光武帝宗庙，然后以诸侯王之礼安葬少帝刘懿。而孙程等十九名宦官因拥立有功，均被封侯，史称“十九侯”。
刘保追感邓太后的恩训，怜悯邓骘无辜，下诏恢复邓骘的宗亲的朝见，并任命邓骘亲属十二人为郎中；同时将汉安帝时被诬陷而死的太尉杨震平反昭雪，以礼改葬。永建元年（公元126年），中常侍张防滥用权势，收受贿赂，司隶校尉虞诩依法追究，但奏章往往遭到扣压，不得上报。虞诩愤慨之至，于是捆绑自己去见廷尉。而张防在刘保面前流泪为自己申诉，导致虞诩被罚去左校服役。
宦官孙程、张贤、孟叔、马国等十九侯得知虞诩因忠获罪，便怀表上殿为虞诩伸冤，并大声斥责张防，刘保见状大怒，当即革除了孙程等十九侯的官职，并以“怀表上殿争功”为罪名，将十九侯全部逐出京师洛阳，徙往偏远的地区。后来虞诩的儿子虞凯与太学生一百多人，都举着旗帜，到另一位中常侍高梵跟前，向他叩头流血，申诉虞诩的冤情。
高梵于是向刘保说明此事，刘保幡然醒悟，便将张防流放边疆，并将其党羽贾朗等六处死或罢黜，当天就释放了虞诩。永建二年（公元127年），刘保考虑到乳母宋娥拥戴自己即位，于是封宋娥为山阳君，食邑五千户。同年，班勇征服了西域的焉耆国，于是龟兹、疏勒、于胘、莎车等十七国皆来服从。永建三年（公元128年），司徒朱伥就孙程等宦官十九侯被放逐一事，上表进谏说：“如果没有孙程等人，陛下就难以即位，如今陛下却忘却孙程等人的大功德，抓住他们一点小过失就革职放逐，如果孙程在放逐的路上死去，陛下将会蒙受诛杀功臣的讥讽。”
刘保听后，采纳了他的建议，将十九侯召回京师洛阳。永建五年（公元130年）春正月，疏勒国王遣侍子入东汉，大宛、莎车国王皆奉使贡献。次年（公元131年），刘保认为伊吾以前是肥沃之地，靠近西域，匈奴经常资助他们，继而抄掠。于是下令在伊吾开设屯田，“如永元时事”