2011年，科亨被任命为摩萨德副局长，积极支持局长塔尔米尔·帕尔多的工作——他们把工作重点对准了伊朗的核开发事业，组织了针对伊朗核科学家的刺杀行动。
去年8月，他被任命为以色列国家安全顾问，为总理内塔的内阁提供国家安全和外交领域的重要情报和政策建议。
在原时空的2016年初，科亨正式被任命为摩萨德局长，在他的任内，组织摩萨德特工从伊朗偷出了半吨重的核武开发文件，5万页文件和163个电脑硬盘。
现在在摩萨德局长塔尔米尔·帕尔多死于这次的爆炸袭击之后，约西·科亨就提前被任命为摩萨德的代理局长。
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