但这理想很丰满现实很骨感，高迎祥这回又在那汉中府城碰了一鼻子的灰，高迎祥领着李自成、拓养坤他们几个围攻汉中府城半个月还是没有打下来。
而在西安的洪承畴侦查到铁贼、献贼这两大贼群进入中原腹地之后，果断的调兵遣将前往汉中对付高迎祥。
洪承畴亲自领着督标营外加固原总兵左光先、临洮总兵孙显祖、西安副将曹变蛟、固原副将尤翟文、固原参将马科这六支官军总共越一万七千人左右分别从堡斜道、倘洛道穿过秦岭进入汉中盆地去围剿高迎祥。
在九月初的时候，这洪承畴领着官军出现在汉中盆地与高迎祥大战一场，这高迎祥等部围攻汉中多时早已经是精疲力尽无力在战，所以这场汉中会战高迎祥吃了一个败仗。
但由于官军缺粮欠饷无法继续深入追击能够扩大战果，所以高迎祥他们虽然吃了败仗还是实力并没有受到多大的损失。
这高迎祥在汉中吃了败仗之后从汉中转进到了汉中盆地与兴安州交界处的西乡县大巴山区中，并且还攻克了西乡县作为临时根据地。
不过这高迎祥却打算以这西乡县作为长期根据地，然后逐步的蚕食整个汉中盆地达到在汉中建立根据地的战略意图。
对于高迎祥的这个打算李自成强烈反对，李自成认为他们目前的实力还尚不足以打退官军的反围剿，这汉中会战就是一个最好证明，所以李自成认为应该继续流动而不应该在此时建立根据地。
于是这翁婿二人就因为这个问题发生了矛盾，最终高李二人分道扬镳，李自成带着他的部队还有他的铁杆小弟张天琳从汉中出祁山道去了甘肃一带打游击。