王世充引军而至，隔门向皇泰帝奏道：元文都等密谋，欲挟持陛下投降李密。臣不敢背叛朝廷，是来讨伐叛逆者也。
此时元文都闻变，早至乾阳殿中，一面分派心腹伺候皇泰国主，一面指挥宫卫将士，凭借宫城抵御兵变。
正在相持之时，段达忽引本部军自宫内而出，命令禁卫：打开宫门，放郑国公以入。
皇宫侍卫闻命惊愕，欲待不从，段达喝道：我乃纳言殿帅，尔等敢造反耶？
宫卫不敢违命，只得打开宫门。王世充入内，先将守卫皆换成自己部下将士，然后引百余勇士进入内苑，拜于紫微观下。
杨侗遣人出于观门问道：卿等夤夜持兵入宫，欲意何为者？
王充奏道：臣执兵惊驾，罪该万死。然臣被元文都、卢楚谋相杀害，不得不为。今卢楚已伏诛，还请陛下诛斩元文都，以安将士之心。若蒙恩准，臣自愿归罪于司寇衙门。
元文都在里面听见，跪倒帝前，涕泣横流道：陛下休听王世充之言。愿是他与魏国公李密不和，见陛下召魏公入朝，故起兵谋叛，与臣等何干！
杨侗见外面火光盈天，兵势渐盛，忖度终不能免，便对元文都道：卿可出去自见王公，向其分剖明白即是。
元文都迁延而泣，将手抱住皇泰帝双腿，不肯起身。
杨侗终于不耐，乃命署将军黄桃树，执擒元文都以出。
元文都便知不幸，临出门顾谓皇泰帝道：恐臣今朝被杀，陛下亦当夕及也。
杨侗知其所说不虚，但也只能火烧眉毛，且顾眼前，不由放声恸哭，挥手遣之。左右观之，无不悲悯默然。
出至紫微观外，王世充以剑柄敲打元文都额头诟骂，元文都只低头不语。王世充便令左右，牵出兴教门外，乱刀斩之。并至府搜出元文诸子，一并斩首庭中。
可叹！元文都徒有拥立皇泰帝之功，及至终了，皇泰帝却不能保其一命。
王世充行凶已毕，复回紫微观外跪倒，参拜天子。
皇泰帝便问：元文都既已伏诛，卿不退兵出宫，却是为何？
王世充：臣有惊驾之罪，若不蒙见宥，恐出此宫门，便身首异处矣。
杨侗道：卿杀奸除恶，以靖朝廷