忽闻马蹄得得，一骑绝尘而来，却是向导细作，向元帅禀报：高昌王麹文泰暴死，未知何故。城内正在发丧，众臣拥立其子麹智盛继位。
侯君集既惊且喜，不再歇兵养马，直接率兵行至柳谷。
探马又来禀报：麹文泰来日安葬，届时高昌国人聚集一处，将军可趁机袭之。
侯君集道：我乃天朝将士，堂堂平叛之阵，正正问罪之师，岂有趁敌下葬时偷袭之理？传令三军，击鼓前进，攻略高昌国各城。
高昌人见唐师来攻，据城坚守。
侯君集遣使劝降不果，遂命军中所带机械工匠，伐木填充城壕，再用推车撞击矮墙，城裂数丈。又用抛车往城中投石，高昌守军被砸死者极众，城上已无立足之地。
于是唐军攻克城池，掳获男女七千余人。侯君集乘胜进兵，包围高昌国都城。
高昌王麹智盛致书唐营：先王虽对唐天子无礼，而我并无过错，望侯公手下留情。
侯君集回书：子若真心悔过，就到军门投降，我不杀你便了。
麹智盛览书，却又不出。侯君集命填平城壕，以抛车攻城，又建十丈高楼，俯视城内射箭。城内人都躲入室内，再也不敢出门。
西突厥欲谷设听闻侯君大名，向西逃走千里，不敢来救高昌。
麹智盛至此无计可施，只得开城投降。侯君集于是俘虏麹智盛及其百官，刻石纪功。
麹氏大凉高昌，就此亡国。
侯君集既灭高昌，不奏天子，擅将其国中无罪众臣及大户发配，私取其家财宝物，据为己有。手下将士见此，上行下效，也开始盗取金银珠宝，挨家搜掠。
诸将违纪胡为，早有亲军报入帅帐。侯君集自己坏法在先，又如何管束他人？只得佯作不知，不敢治将士之罪，由是军纪大乱。
高昌被俘众臣怨气冲天，便在侯君集班师回朝之际，将唐军将领所作所为诉于天子。
唐太宗本因灭国之胜大喜，闻奏复又转怒，便命司法官将侯君集下狱。中书郎岑文本上书求情，以为侯君集有灭敌国大功，且是国公之尊，不可轻加屈辱。
李世民怒气不息，由是没收侯君集与诸将抢掠所得，然后将侯君集