首先是中枢的机构，将原有的陆军部、海军部和空军部以及总参谋部、三军联席委员会的职能重新划分，并强化内阁力量，设立行政委员会、国防委员会和战时经济委员会三大协调机构，协调各军种、前线与后方之间的合作。
其次，军部也要对从去年末到现在的战争情况进行总结和反省。
性质上最严重的自然是第二军在战役后期的行为，往小了说是贪功冒进，往大了说就是违反军令。
到目前为止，这还只是个人问题，因为国家制度问题，军国主义士壤并不存在，只要及时整顿处理，杜绝后效不是问题。
除了战场上的问题，后勤问题更为严重，影响也更远。
从荷属东印度战役到现在，大约70天的战斗中，国防军所暴露出来的后勤组织问题数量不少。
南洋地区潮湿、多雨、高盐，环境恶劣，而太平洋只会更糟糕；南洋遥远，而太平洋更遥远；作为渡海的远征军，南洋方面军规模巨大，而太平洋更大。
如果目前的情况都做不好，不能及时改进，那么太平洋的仗就纯粹是烂仗了，美军在太平洋的后勤，呵呵
总的来说，后勤就是三条，第一是规划，第二是物资管理，第三是人事。
在南洋战役期间，后勤部对于战争进展的预估严重不足，备案数量十分有限，对于快速变化的战场局势只能够临时出招，跑得快的第四军一度要以缴获的英军补给为生。
同时，这几场战役中还没有发生失去制空权、航线遭到潜艇破坏等严峻情况出现，未来与美军交战，这些都是很大概率会发生的事情。
其次是物资管理，目前做的比较好的还是本士部分。
订货厂商、物资种类、物资质量、物资规格都已经严格统一，依照标准验收、运输。
对于未来所需要应对的战争规模所指定的物资标准也在逐步落实中。
而地方兵站、仓库出现的贪污、倒卖问题也在最近得到了有效遏制，在总统命令下，军法司开启了全国巡查，一些重罚也被破格允许。
前线的物资管理就要麻烦的多了，南洋的气候等问题自然要专门应对，兵站仓库建设标准和规格亦需