2015-16赛季，2015年夏天，皇马曾将纳瓦斯加入到与曼联门将德赫亚的转会交易之中，但交易最终未能达成。赛季开始后，随着伊戈尔·卡西利亚斯离开球队，纳瓦斯成为球队的首发门将。在赛季初期，纳瓦斯表现神勇，各项赛事连续不失球时间达到517分钟，尤其是427分钟的联赛开局不失球时间，位列队史第二，距队史记录只差5分钟。
在赛季结束时，纳瓦斯以34轮联赛丢28球13场零封的表现，助皇马仅以1分落后于巴萨的成绩获得西甲联赛亚军。在欧冠赛场上，纳瓦斯以12场比赛10次零封的表现，助球队最终夺下欧冠冠军奖杯。
2016-17赛季，由于在上赛季的欧冠赛场上左脚受伤，纳瓦斯在本赛季的西甲比赛中状态不佳，代表皇马出场27次，仅交出5场零封的成绩，但仍帮助队获得当年西甲联赛冠军。在欧冠赛场上，纳瓦斯出战12场虽然只得到1场零封，但在决赛中通过开场后的几次精彩扑救抵御了对手的攻势，帮助皇马以4-1战胜尤文图斯蝉联冠军。
2017-18赛季，整个赛季，纳瓦斯在西甲联赛出战27场，获得7场零封。在欧冠出战11场，获得2场零封。2018年5月1日欧冠半决赛阶段，纳瓦斯单场做出8次扑救，助皇马淘汰拜仁慕尼黑。
5月26日欧冠决赛，纳瓦斯助皇马3-1战胜利物浦，夺得欧冠三连冠，成为欧冠改制后第一位三连冠门将。同时这场比赛也是纳瓦斯加入皇马后的第100场胜利，至此纳瓦斯为皇马出战141场，取得100胜27平14负，胜率接近71。在赛季结束后，纳瓦斯被欧足联评为欧冠赛季最佳门将。
2018-19赛季，本赛季皇马以3500万欧元的价格引进库尔图瓦后，纳瓦斯出场时间骤降，逐渐成为二号门将，产生不满情绪，在节目中公开抱怨。2019年4月6日，纳瓦斯成为第一位在西甲联赛中为皇马出场100次的外籍门将。
2019年9月，巴黎圣日耳曼俱乐部以1500万欧元的转会费签下纳瓦斯，签约时间4年。在