虽然鲁尼与曼联合同还未到期，但上赛季经过调整后，鲁尼在场上的位置更深入中路，他坚信自己能在中场发挥更重要的作用。他对签约新合同延长其在曼联的效力时间持乐观态度，并希望在曼联结束他的球员生涯。
2016-17赛季开始阶段鲁尼表现平稳，英超联赛出场25次，打入5粒进球。但仍旧饱受伤势的困扰。赛季后期竞技状态有所下滑，发生过传球失误的情况，时任曼联主教练穆里尼奥因此减少了鲁尼的首发次数。该赛季也是鲁尼加盟曼联以来进球数最少的一个赛季，鲁尼的低迷表现让媒体纷纷猜测其会在这个赛季结束后就离开曼联。
2017年7月9日，鲁尼正式离开效力了13年的曼彻斯特联，共计代表曼联出战559场比赛，进球253粒，助攻131次。
2017年7月9日，鲁尼回归老东家埃弗顿。值得一提的是，这次鲁尼身穿的是10号蓝色球衣。鲁尼在采访中表示，再次穿上蓝衫的这天令他“激动澎湃”。
鲁尼在2017-18赛季英超联赛中代表埃弗顿出场31次，共收获10粒进球，2次助攻。至此，鲁尼在英超联赛总共经历了16个赛季，他参加了491场英超联赛，在英超总出场次数中并列第15位。鲁尼在英超的射门次数超过350次，位列英超史上第一。鲁尼是英超联赛历史上进球数排名第二的射手，在曼联和埃弗顿的491场比赛中共打进208个进球。同时，鲁尼在英超贡献出103次助攻，排名历史第三。
2018年7月10日，鲁尼正式加入美国职业足球大联盟华盛顿特区联，身穿9号球衣。鲁尼的到来也创造了华盛顿联史上最昂贵的转会记录。在该俱乐部共出场52次，贡献了25粒进球。
2019年10月，美国职业足球大联盟该赛季结束时，鲁尼就与德比郡签署了一份18个月的合约，确认了即将回归英格兰足球。
2020年1月1日以球员兼教练的身份加盟英超球队德比郡。在宣布退役并成为德比郡临时主教练之前共出场35次，打进了7个进球。2021年1月15日，鲁尼从德比郡球队退役，专注于执教该队。