10人为一小旗。
5小旗为一总旗。
两个总旗一百户。
十个百户一个千户。
五个千户为一卫，共计5600人。
而从明中后期开始，军卫所渐渐荒废，朝廷用兵多为募兵制，军队编制就乱了，其中最著名的就是戚家军的编制。
12人为一队：队长（鸟铳倭刀）一人；伙夫一人（双尖扁担）；长枪手两人；刀棍手两人；牌刀手两人；火枪手两人；快枪手两人。
3队为一旗，每旗设旗总1人，共37人。
3旗为1局，每局设百总1人，共112人。
4局为一司，每司设把总1人，共449人。
2司为一部，每部设千总1人，共899人。
3部为一营，设将官1人，中军1人，火器把总1人，为一营，共计2700人。