英格兰足球联赛成立一年之后，1889年纽顿-希斯lyr队联合英格兰东北部其他11支球队，创办了英格兰足球同盟（the football alliance）联赛。这12支球队里面包含了很多如今耳熟能详的名字：曼城队（当时叫阿德维克队ardwick）、斯托克城队、诺丁汉森林队、谢菲尔德星期三队等等。
这个新联赛与英格兰足球俱乐部联赛采取一样的赛制，12支球队之间的比赛也非常精彩。在第一个赛季里，纽顿-希斯lyr队最终获得了第八名。
纽顿-希斯lyr队除了参加联赛，他们在1890年正式脱离铁路公司，更名为纽顿-希斯队——这是球队职业化的关键一步。球队首先去掉了lyr的字样，和铁路公司彻底脱钩，变成一个自负盈亏的足球俱乐部。原来球队的人员是离开球队回归铁路公司，还是留在球队脱离铁路公司，需要作出选择决定。
另外，球队之前可以依托铁路公司开支，现在就要自筹资金，租赁办公场所设施，租赁球场，自行组织比赛。
关键的问题，俱乐部需要自负盈亏，一切都要靠自己来谋求生存与发展。
纽顿--希斯俱乐部很快就吃到了苦头，独立营运的俱乐部需要资金，没钱寸步难行。俱乐部脱离铁路公司之后的第一笔资金完全属于自筹，靠几个球员自己掏腰包。这很快就导致入不敷出，他们不得不继续募捐，并且积极地寻求卖出股份，吸引资金的途径。
职业球队需要球员，需要教练，需要工作人员，更需要商业人才。这一切对于纽顿-希斯俱乐部来说都太过于艰难，他们的管理层一开始并没有什么经验。
特别是没有募集到足够的俱乐部份额资金之后，俱乐部发现靠比赛是养不活自己的。参加一场比赛需要支出的费用并不少，有时候甚至门票收入都很低。
纽顿-希斯俱乐部在很长一段时间里都无法解决收不抵支的窘境，职员和球员的工资都无法及时足额发放。
纽顿--希斯俱乐部之外，和他们一样状况的并不少。很多球队最终没有办法生存，就此消失于历史的尘埃之中。
纽顿-希斯俱乐部想方设法，艰难