厌祷是当时常用的祈祷鬼神的方法，严格来说可以分成两类：一类是厌胜，就是埋东西来承恩致福；另一类是厌魅，就是埋东西来诅咒别人。萧统这个做法本质上属于厌胜。
但不怕没好事，就怕没好人。萧统有两个亲信互相争风吃醋。一个觉得另一个抢了自己的地位，于是就偷偷跑到萧衍那里告状，说对方偷偷帮太子做厌祷，可能会影响到皇上。
萧衍当即派人去墓地排查，果然发现了厌祷的物品。
萧衍可不管蜡鹅是什么意思，你们胆敢在对我有利的地方放这些乱七八糟的东西，摆明了是要破坏风水谋害朕。他大为震怒，下令彻查此事。中书令徐勉担心此事会像汉武帝时巫蛊之祸那样扩大化，最终牵连到太子，于是拼死上谏，好说歹说总算劝住了萧衍，最终只是把那个出主意的道士给砍了。
可惜徐勉这是典型的好心办坏事，因为如果搞清楚前因后果，萧统还可以自证清白，但现在这样胡乱结束，萧统想辩解也没机会了。
从此之后父子之间就出现了隔阂，萧统由于忧惧，心理压力与日俱增，身体状况也开始一天不如一天。
三十一岁那年，萧统在乘舟时不慎落水受伤，病情很快恶化，他怕父亲担心，不许随从把消息告诉萧衍。等一个月后萧衍得到报告的时候，萧统已经去世了。民众得知消息之后大为惊愕，举国上下悲恸不已。
按规矩来说，萧统的长子萧欢是第一继承人，但萧衍由于之前跟萧统存在芥蒂，不想再立萧统一脉，打算改立三子萧纲。
这个行为严重不合规矩，萧衍担心大臣们有意见，前后犹豫了一个多月才颁布册立新太子的诏书。
诏书一出，朝野哗然，反对声音不绝于耳。为了安抚人心，萧衍把萧统的儿子都封到大郡当王爷，女儿等同于正式的公主，原太子妃蔡氏的待遇也保持不变，费了很大的力气才算暂时压制住舆论。但萧统的死对南朝是极大的损失，影响非常深远。
第四个出事的是他的五儿子萧续。
萧续比高欢早去世四天。关于萧续没有什么特别的故事，他虽然也是丁令光所生，