尼米兹接受了杨洪的建议，决定暂缓下一步的进攻。菲律宾战役的第一阶段结束。实际上，由于麦克阿瑟的失误，美军在第一阶段，尤其是莱特岛登陆战和莱特湾海战，可谓说是以损失惨重来形容。共损失3艘重型航母，6艘护航航母，战列舰等主要水面舰船37艘，仅海军便损失余人，是美海军建军以来最大的损失。当然，陆军和海军陆战队的损失也不小，有近人伤亡。
尼米兹不得不考虑舰队的休整问题，还有新的整合。华府也正式下令改组西太平洋战区，麦克阿瑟最终没能保住他的司令官职务，乖乖回家养老。斯普鲁恩斯被任命为西太平洋战区司令。他的任命同时结束了美丽国在异时空一个独立军种的存在，美海军陆战队被正式划归海军。
斯普鲁恩斯就任发布的第一道任命居然是任命原参谋长萨瑟兰为地面作战集群司令，地面作战将分为三路，第一路由美第6集团军司令沃尔特·克鲁格负责，辖美第6集团军和中国远征军第165、166、205、206师，目标吕宋岛；第二路由中国第3集团军司令廖耀湘负责，辖中国22、50、113师，以及美军第5集团军24军，负责扫荡菲律宾其他岛屿；第三路由中国军第1集团军司令杨洪负责，辖中国军第47、112、201师，以及美第5集团军第10军，负责南下，夺取加里曼丹岛，彻底切断日军南方方面军的海上通道。
半个月后，廖耀湘所率第二路向西，横扫保和岛、塔尼翁岛·、内格罗斯岛、班乃岛等菲律宾中部岛屿；沃尔特·克鲁格率第一路从萨马岛北上，踏上吕宋岛，先后攻占索索贡、黎牙实比、伊利加、布西等要地，正沿邦多克半岛一路北上；杨洪则率领第三路南下，进攻棉兰老岛，占领前进基地后，由第3舰队协助，向加里曼丹岛进发。
日军也利用这个月时间，加强了菲律宾本岛（吕宋岛）的防御，从一些不重要的岛屿收缩兵力，山下奉文将驻吕宋岛日