但这个制度实行到明朝景泰、天顺年间就出问题了，无法执行下去。这主要有以下三方面的原因。
首先，刷卷并不是监察御史一人独立能完成的，往往是需要两三位监察御史配合到一处进行刷卷，同时还需要聘请大量的书吏配合，耗费大量的纸张。
后来朝局变动频繁，朝廷没有精力也没有人力进行大规模的刷卷。土木之变中，随英宗亲征的六十余名官员死伤殆尽，好不容易恢复元气，到了景泰八年又发生了夺门之变，于谦、王文等之前拥立朱祁钰登基的官员被清洗，随后石亨、曹吉祥等人也被论罪下狱。动荡的政局使朝廷无法正常运行，监察也不得不停了下来。
到了崇祯一朝，御史的清流早已不复存在，御史和朝臣们一起同流合污，想着怎么捞钱，怎么欺骗皇帝为己任了。
崇祯偏偏又是个好糊弄的，很容易被大臣们牵着鼻子走。