从生理角度来看，《皇帝内经》将人体的各种生理活动归结为阴阳的作用。例如，阳气主温煦、推动，阴气主濡养、宁静。阳气的升腾与阴气的沉降相互配合，维持着人体的正常生命活动。同时，脏腑、经络等各个系统也都有着阴阳之分，它们相互协调、相互为用，共同维持着人体的健康状态。这种对阴阳在人体生理中作用的认识，体现了周易哲学中阴阳相互依存、相互转化的思想。
而在病理方面，《皇帝内经》认为疾病的发生正是阴阳失衡的结果。当人体受到内外因素的干扰，导致阴阳的平衡被打破时，就会出现各种疾病症状。例如，阳气过盛或阴气不足都可能导致疾病的发生。这种对疾病本质的认识，与周易哲学中阴阳对立统一的观念是完全一致的。它揭示了疾病的发生并非孤立的现象，而是阴阳失衡在人体上的具体表现。
进一步深入分析，我们可以发现《皇帝内经》在运用周易哲学思想时，还体现了阴阳动态平衡的特点。阴阳的平衡并非静止不变的，而是在不断地变化和调整中。人体在生命活动过程中，始终处于阴阳的动态平衡之中，这种平衡是相对的、动态的。当外界环境发生变化或人体自身的调节功能出现障碍时，阴阳的平衡就会被打破，从而引发疾病。因此，保持阴阳的动态平衡对于维护人体健康至关重要。
同时，《皇帝内经》还强调了顺应自然规律对于维持阴阳平衡的重要性。周易哲学认为，宇宙万物都遵循着一定的规律运行，人体作为自然的一部分，也必须顺应自然的变化。《黄帝内经》提出了“法于阴阳，和于术数”的理念，要求人们根据自然界的阴阳变化来调整自己的生活方式和行为习惯，以保持阴阳的平衡。例如，四季的更替、昼夜的变化等都对人体的阴阳平衡有着重要的影响，人们需要根据这些自然规律来合理安排生活和养生。
此外，《黄帝内经》还探讨了通过调节情志来维持阴阳平衡的方法。情志活动与人体的阴阳平衡密切相关，过激或不良的情志会导致阴阳失衡，从而引发疾病。因此，《黄帝内经》强调要保持平和的心态，避免过度的情志波动，以维护阴阳的平衡。这也与周易哲学中关于情感与理性、动与静的平衡思想相契合。
在治疗方面，《皇帝内经