在关于前面提到的找出蛋白质的三维结构的“三维”一词，其实是基于当时广大读者的习惯来描述的。
需要注意的是，“克里斯蒂安·安芬森”曾经在阐述蛋白质折叠理论时，他的原文并没有直接使用过“三维结构”一词；包括“雨城的母亲”在给孩子们讲解有关生物计算学方面的相关理论知识时也是如此。
克里斯蒂安·安芬森当时唯一使用过的词语是——天然构象（native conformation）或是天然结构（native structure）。包括一九七三年他本人在aaas科学杂志出版社发布的《principles that govern the folding of protein chains》（《指导蛋白质链折叠的原则》）的“原文字”中的论文中，也从来没有直接使用过“三维结构”一词，甚至“三维”二字都从来没有出现过。如果有很多都是经过翻译后才有的。
雨城母亲使用的则是“一级结构”，或是“四维空间”中的“一级结构”等词语，但整体还是以“一级、二级、三级、四级结构”这些词语为核心。
其实根据阿尔伯特·爱因斯坦的“广义相对论”，蛋白质的立体结构要是使用“三维结构”一词，只能适用于“计算机中模拟计算蛋白质的折叠问题”，并不适用于现实中蛋白质的形容，这是不准确的，也是不严谨的。
因为爱因斯坦的广义相对论认为，时间和空间是“同一世界”的不同维度，我们所处的宇宙都是四维的；同时还指出“时间”与“空间”并不是绝对的，只是相对存在。
因为物质只有在空间中运动，才会有时间的观念。如果没有空间，没有物质，也就没有宇宙，更不存在时间。时间因物质的运动而改变，空间因为物质或能量的存在而弯曲变得不均匀。
换句话简单的理解是，物质只有在空间中运动才会有时间的观念，因为时间只是人们用来记录万物万事发生变化的一种计量方式，并不是说它原本就是实质的存在；还有例如人们最耳熟能详的“星期”“年月”以及“世纪”等，皆是如此，其实本质上都是一种计量方式，并不是实质存在的。
也就是说，假设宇