在全球合作方面，矛盾与分歧不断涌现，让本就艰难的应对危机之路愈发坎坷。一些发达国家凭借自身先进的科研设备与雄厚的经济实力，试图主导整个合作进程，将自身利益置于首位。他们在资源分配、科研成果归属等问题上，提出了诸多不合理的要求，这使得众多发展中国家感到不满。
发展中国家虽也渴望为保卫地球贡献力量，却因资源有限，在合作中常处于被动地位。例如，某些发达国家要求在关键科研项目中占据主导决策权，并且对研究成果享有绝对控制权，发展中国家只能承担一些辅助性工作，却难以从中获取实质性的技术与知识。这引发了发展中国家的强烈抗议，他们认为在这场关乎全人类命运的危机面前，每个国家都应享有平等的合作机会与权益。
这种利益分配的不均导致部分国家间的合作关系紧张，甚至出现了一些国家退出某些合作项目的情况。这不仅严重影响了科研合作的进度，使得原本计划通过全球科研力量共同破解的难题，如黑暗势力战舰的弱点分析、精神系异能与现代科技结合的应用等，陷入停滞，还削弱了全球整合资源建立防御体系的力度。
在防御体系建设方面，各国在资源调配的方向上也存在巨大争议。一些沿海国家认为应重点加强海洋防御，因为他们担心黑暗势力可能会从海洋方向发动攻击，海洋广阔的面积和复杂的环境为敌方提供了更多的隐蔽和突袭机会。他们主张投入大量资源研发新型海洋防御设施，如海底监测系统、大型海上防御堡垒等。
然而，内陆国家则强调要加强陆地防御，尤其是对重要城市和战略要地的防护。他们认为陆地是人类生存的重要基础，一旦黑暗势力突破陆地防线，将对人类社会造成毁灭性打击。因此，应优先建设坚固的陆地防御工事，配备先进的防空、反导系统等。
这种在防御重点上的分歧使得资源无法得到合理有效的分配，许多资源在争论中被浪费，防御体系建设的整体进度受到严重影响。本应迅速构建起的全球性防御网络，因各国之间的意见不合，迟迟无法成型。
此外，文化和意识形态的差异也在