而对于柳巳，南宫瑾虽与他接触不多，但也有所耳闻。据说柳巳在柳家本就是个不受宠的孩子，平日里总是默默钻研学问，鲜少参与家族中的那些是是非非。南宫瑾仔细梳理了手头所有关于柳巳的消息，却发现根本没有任何确切的证据能够表明他们参与了此次的谋逆之举。
这让南宫瑾着实为难了起来，一方面，柳太傅谋逆乃是板上钉钉的事实，朝廷上下都在关注着后续的处理，自己身为皇帝，必须要秉持公正，依法办事，不能仅凭个人的主观判断就轻易下结论；可另一方面，自己内心又着实相信柳甲和柳巳很可能是无辜的，若就这样让他们蒙冤受屈，那实在是有违自己的本心，也对不起和柳甲多年的情谊。
南宫瑾揉了揉太阳穴，心中暗自思忖着：“此事还需慎之又慎，绝不能草率定夺。看来得再派人去细细查访一番，务必把所有的细节都弄清楚，也好还他们一个清白，只是这过程怕是不会轻松呐。”
于是，南宫瑾叫来心腹大臣，吩咐他们务必抽调精干力量，从各个角度去重新调查柳甲和柳巳与柳太傅一案的关联，不放过任何一个可能的线索，力求早日查明真相，让这桩复杂的案子水落石出，给朝廷和天下一个交代。
那夜，柳太傅所在的天牢中一片死寂，只有偶尔传来的狱卒巡逻的脚步声打破这份寂静。而柳太傅在吃下饭菜后，毒性渐渐发作，他痛苦地挣扎着，却终究没能逃过这一劫，就这样悄无声息地被最后的饭菜毒死在了狱中，他到死也不知道是谁这么急切的要了他的命。
南宫瑾很快便得知了柳太傅在狱中身亡的消息，他眉头紧锁，心中清楚这背后定然没那么简单，柳太傅谋逆大案刚出，此刻突然暴毙，想必是有人想要杀人灭口，让那些还未被挖出的秘密就此石沉大海。只是当下这案子牵连甚广，各方势力都在暗中窥探，若是大肆追查柳太傅的死因，怕是又会引起朝堂和后宫的诸多动荡，不利于如今大渝刚刚稳定下来的局势。
经过一番深思熟虑，南宫瑾权衡利弊后，命人对外宣称柳太傅是畏罪自杀。对外的说法便是，柳太傅深知自己犯下的谋逆大罪不可饶恕，自觉走投无路，最终选择了以死谢罪。
而恰好在柳太傅的牢房内，还发现了一份所谓的告罪