原来他也在为《素问》作注，这十年来也完成了十几卷，可马莳就九卷便成一家之言，而他还有一小半未完成。本来他是有望在四十岁前完成这部注书，只是先前支援边地，加上又花了些时间去研究脉诊，耽搁了两年，即便如此，再有个六七年也能完成《素问注》。
《素问注》便是他给自己注书取的名字。
俞尧日却笑道：“山甫兄，你就知足吧，太医院谁不知道，你的《脉语》，玄台的《素问注》，一时瑜亮？”
众人点头，显然都认可这说法，只是他们不知道，吴崑在后世也常和马莳并称，都是经注大家，《医林续传》更是盛赞：医林有不满焉者，非愚则狂而已。
“当世脉书，无外乎李时珍之《濒湖脉学》、汪机之《脉书要语》、《矫世惑脉论》、吴崑之《脉语》。”
“听听，都把山甫你推向了当世三大家，与李时珍、汪机并称。”陈实功说道。
把吴崑的《脉语》和李时珍、汪机的着作并论，由此可见众人对他的认可。
李时珍此时闻名于世的，不是还未问世的《本草纲目》，而是《濒湖脉学》，若没有《濒湖脉学》，时医可能都不会知晓李时珍之名。