在指挥中心内，他们看到了暗灵教团的首领——一个全身笼罩在黑暗灵能之中的神秘人物。首领看到林宇等人的到来，并没有表现出丝毫的惊慌，反而发出了一阵疯狂的笑声。他操控着强大的黑暗灵能，朝着特别行动队发动了一次致命的攻击。
林宇迅速反应过来，他与队员们组成了一个灵能防御阵型，共同抵御首领的攻击。在抵御攻击的同时，林宇也在寻找着首领的破绽，他发现首领在发动攻击时，其背后的黑暗灵能会出现短暂的波动，这应该就是他的弱点所在。
林宇决定冒险一试，他等待着首领再次发动攻击的时机，当首领的黑暗灵能波动出现的瞬间，他集中全身的力量，发动了一次出其不意的攻击。这道攻击准确地击中了首领的弱点，黑暗灵能瞬间出现了紊乱，首领也受到了重创，发出了一声痛苦的惨叫。
特别行动队的队员们抓住这个机会，纷纷发动攻击，对暗灵教团的首领和核心成员进行了最后的围剿。在一场激烈的战斗后，暗灵教团的首领被成功地消灭，其核心成员也大多被击毙或俘虏，暗灵教团的指挥中心被彻底摧毁。
随着暗灵教团指挥中心的覆灭，其在宇宙中的其他势力也开始陷入混乱和瓦解。宇宙联盟和圣辉联邦的特别行动队趁机对暗灵教团的残余势力进行了全面的清剿，彻底消除了这个对宇宙灵能平衡恢复计划的巨大威胁。
在成功击败暗灵教团后，“灵能平衡重塑计划”得以重新顺利推进。随着一座座灵能平衡调节塔的建成并投入使用，以及灵能净化与回收工程的持续开展，宇宙中的灵能平衡状况逐渐得到了改善。各个星系和星球之间的灵能流动变得更加稳定和有序，被污染的灵能区域也逐渐得到了净化和恢复，宇宙的生态环境和文明发展开始呈现出一片欣欣向荣的景象。
然而，林宇和宇宙联盟、圣辉联邦的其他领导者们并没有因此而放松警惕。他们深知，宇宙的奥秘无穷无尽，未来还可能会出现各种未知的挑战和危机。为了更好地应对这些潜在的威胁，他们决定加强对宇宙的监测和探索力度，建立更加完善的预警机制和应急响应体系，同时继续深入研究灵能的本质和宇宙的演化规律，不断提升自身的实力和智慧，以便在