经过一番激烈的战斗，他们成功摧毁了水晶矿脉与能量屏障的连接点。能量屏障逐渐减弱，林萧趁机发动全力一击，打破了能量屏障，顺利拿到了代表秩序之力的星辰圣石。
与此同时，另外两支探索小队也经历了重重困难。前往“虚空风暴带”寻找平衡之力星辰圣石的小队，遭遇了强大的宇宙风暴和神秘的暗物质生物的袭击。风暴中的能量乱流不断冲击着飞船，暗物质生物更是能够穿透飞船的能量护盾，对队员们造成直接攻击。但队员们凭借着顽强的意志和精湛的战斗技巧，最终战胜了困难，找到了星辰圣石。
而前往“永恒冰川星系”寻找净化之力星辰圣石的小队，则面临着极端寒冷的环境和冰川巨人的阻拦。冰川巨人拥有强大的力量，能够操控冰川和寒冰进行攻击。队员们在与巨人的战斗中，发现了巨人对某种特殊频率的声波敏感，于是利用飞船上的声波武器，成功击退了巨人，取得了星辰圣石。
三支小队带着星辰圣石回到总部，林萧等人立刻开始研究如何利用星辰圣石修复混沌原力的封印。经过无数次的实验和模拟，他们终于找到了正确的方法。
林萧带领队员们来到混沌原力封印的地点，将三颗星辰圣石放置在特定的位置。星辰圣石释放出强大的光芒，三种力量相互交织，形成了一道强大的封印之力，缓缓融入混沌原力的封印中。在星辰圣石力量的作用下，混沌原力的封印逐渐修复，宇宙中被混沌原力破坏的平衡也开始慢慢恢复。
然而，就在封印即将完全修复之际，一股强大的黑暗能量突然从宇宙深处袭来，试图阻止封印的完成。林萧立刻察觉到，这股黑暗能量正是暗影议会残留势力的最后反扑。他们不甘心失败，企图利用混沌原力的再次失控，重新掌控宇宙。
林萧迅速变身成萧刻奥特曼，迎向黑暗能量。他与暗影议会残留的黑暗战士展开了激烈的战斗。黑暗战士们拥有强大的黑暗力量，他们的攻击带着腐蚀和毁灭的气息，但林萧毫不畏惧，凭借着萧刻奥特曼的强大力量和智慧，一一化解了他们的攻击。
与此同时，队员们也纷纷投入战斗，他们利用先进的武器和战术，与黑暗战士们展开殊死搏斗。在激烈的战斗中，林萧发现黑暗战士