他们开始排查城市各个关键设施和人员密集区域。在调查港口时，发现一艘可疑船只。上船检查时，里面空无一人，但有一些奇怪的货物箱。正当他们打开一个箱子时，突然弹出一阵烟雾，众人晕倒。
等醒来时，发现身处一个封闭空间，周围全是电子设备。一个投影画面亮起，竟是之前的幕后主使模样：“欢迎来到我的新基地，这里就是你们的葬身之处。”就在这时，江汉发现脚下有通风口，他暗示队友。接着，他们合力撬开通风口，依次钻了进去。沿着通风管道爬行，意外找到了中控室。季洁冲进中控室关闭了所有安保系统，他们顺利逃离船只，并且在船上安置了炸药。随着一声巨响，敌人的这个据点被炸毁，城市暂时又恢复了安宁。
但季洁心里清楚，这短暂的安宁之下依然暗流涌动。几天后，城中出现一些莫名失踪的流浪汉案例。重案六组介入调查，顺着蛛丝马迹追踪到一个废弃的地铁站。地铁站里弥漫着一股腐臭与金属混合的味道。他们小心翼翼地深入，发现墙壁上刻满了之前见过的诡异符文。
突然，周围温度骤降，一群透明的幽灵状物体浮现。它们呼啸着冲向重案六组。江汉拿起特质喷雾朝着幽灵喷洒，发现有一定的驱散效果。季洁指挥大家边退边寻找根源。
在站台尽头，他们发现一个散发蓝光的水晶球，似乎是召唤这些幽灵的源头。李少成勇敢地冲上前去想要击碎水晶球，却被一股力量弹开。田蕊急中生智，用绝缘手套包裹石块砸向水晶球。水晶球破裂，幽灵瞬间消散。
正当他们以为危机解除时，季洁的手机响了，是老郑打来的，说城里多处出现奇异现象，重案六组又要奔赴新的战场，继续守护城市。
重案六组兵分几路去处理各处突发的奇异现象。季洁和江汉一组，来到一处商场，里面灯光闪烁不定，顾客们惊慌失措地往外跑。他们走进商场，感觉一股寒意扑面而来。江汉发现电梯处有异常，两人走近时，电梯门突然打开，喷出一股黑色雾气，里面隐隐有身影晃动。季洁拿出手枪警戒，江汉用强光手电筒照射，雾中的身影发出痛苦的嘶吼。他们发现这些身影是被怨念附身的人偶模特。
与此同时，李少成