重案六组的办公室里，气氛紧张得让人窒息。队员们盯着电脑屏幕，手指在键盘上飞速敲击，不放过任何一个细节。突然，技术部传来消息，神秘号码的信号源定位在城郊的一个废弃工厂。季洁当机立断，带领一队人马迅速出发。
与此同时，法医组也有了新进展，在逃犯曾在一家小诊所就医，留下了行踪线索。郑一民带着另一队人赶往诊所。
雨又开始淅淅沥沥地下起来，两队人马在夜色中疾驰，他们都清楚，真相就在前方，一场与罪犯的终极对决即将展开。
季洁带领的队伍率先抵达城郊废弃工厂。工厂被黑暗笼罩，透着一股阴森的气息。他们小心翼翼地靠近，突然，一阵嘈杂的机械声打破了寂静。季洁示意队员们隐蔽，自己则顺着声音的方向摸索过去。在工厂的深处，他们发现了一个神秘的实验室，里面摆满了奇怪的仪器。就在这时，一个黑影从角落里窜出，季洁眼疾手快，迅速将其制服，竟是神秘号码的使用者。原来他只是个被雇佣的技术人员，幕后主谋另有其人。
与此同时，郑一民那队人在小诊所找到了在逃犯的踪迹。他们顺着线索追踪，在一处旧公寓将其包围。在逃犯狗急跳墙，试图反抗，但最终还是被制服。审讯中，他交代了自己是被一个神秘组织指使，而这个组织似乎和多起案件都有关联。重案六组意识到，他们揭开的只是冰山一角，更大的阴谋还在后面。
季洁和郑一民迅速将两个线索汇总，意识到这个神秘组织势力庞大且隐藏极深。他们决定加大调查力度，对神秘组织展开全面围剿。重案六组的队员们日夜奋战，不放过任何一个细节，在海量的数据和线索中抽丝剥茧。终于，他们发现神秘组织的核心人物频繁出现在一座豪华酒店。季洁和郑一民带领队员们乔装打扮，潜入酒店。在酒店的地下密室里，他们发现了一个巨大的犯罪网络，里面堆满了非法武器和机密文件。然而，就在他们准备实施抓捕时，神秘组织察觉到了他们的行动，启动了机关，将他们困在了密室中。密室里的氧气逐渐减少，情况十分危急。季洁冷静分析，找到了机关的破绽，带领队员们成功逃脱。最终，他们在警方的支援下，一举捣毁了神秘组织