郑成功的果断回师，使他赢得了时间与主动权。
郑军在野战上的能力，要远远超过攻城战，郑成功所取得的辉煌胜利，几乎都是在野战中取得，这与郑军严苛与有效的训练是密不可分的。
三月八日，郑成功巡视了江东周边的地形，并安排了相应的军事部署。江东桥位于同安通往漳州的必经之路上，这样既要迎战驻扎在同安的陈锦清军，又要提防漳州清军在后侧的偷袭，所以郑成功做了精心的战斗准备。
郑成功设置了一条弯月形的防线，这条防线以戎旗中军营为中心，两翼向前延伸，左翼有甘辉的亲丁镇、陈俸的礼武镇，林胜的援剿左镇，万礼的前冲镇，陈埙的正兵营，右翼有援剿后镇、右冲镇、中冲镇等。其中甘辉的亲丁镇与陈俸的礼武镇由于在长泰战役阻击清军援军的杰出表现，被郑成功置于阵地的最前沿。
除此之外，郑成功还派右先锋黄廷率左冲镇与奇兵镇据守东北部，因为东北山地是一个制高点，以防止清军占据这个有利地形；左先锋苏茂则在东尾寨内外设置伏兵，前锋镇将领赫文兴则率一千余人马，埋伏在中军营的前方树林中，作为一支机动部队，这样无论是左翼还是右翼出现危险时，赫文兴可以马上投入前往援助。
郑成功还秘密派遗黄山的援剿右镇埋伏在深青桥、鸿渐尾一带，作为一支奇兵，在清军溃败之时，以截断其退路。
从军事部署上看，郑成功占据地利优势，看来在野战方面，郑成功在指挥布阵上已经炉火纯青，他称之为\"势如常山之蛇，击首尾应，击中则首尾俱应。”剩下来的，便是考验郑军在战斗中的勇敢与意志力了。
这次会战是郑成功起兵以来规模最大的一次战斗，在此之前，郑军在战斗中所遭遇的清军，很少超过一万人，而且多是地方部队。而这回，清军由浙闽总督陈锦亲自督率，不仅的数量上有数万人之多，而且还有为数不少的铁甲骑兵，这陈锦非泛泛之辈，他在浙东剿灭了以鲁王朱以海、定西侯张名振为首的抵抗力量，为清廷立下赫赫战功。
面对强大的清军，郑军中有些士兵产生畏敌情绪。自从清军入关南下后