成员等级由上至下分别是总队长、副总队长、分队长、班长、普通成员。
总队长协助火影管理暗部的一切事务，副总队长协助总队长完成各项工作。
一共设置四个分队，设分队长一名，每个分队加上分队长共17人，下辖四个班。
每个班由四名忍者组成，分别是一名班长和三名成员。
之前暗部的总队长是一个完全由猿飞日斩一手提拔的优秀平民忍者，副总队长是猿飞日斩得大儿子猿飞新之助，也就是后来木叶丸的父亲，四个分队长，则是千手扉间当初留下的那几个。
这样的安排，在最大程度的保证暗部的忠诚的同时，又保存了暗部的实力。
不过猿飞日斩不知道的是，整个暗部除了他的儿子猿飞新之助，其他人，早就被宇智波断给控制了。
要知道宇智波断和大蛇丸对于洗脑的研究可不是没有进展。
这些人平日里只是不表现，配合着猿飞日斩哄宇智波断开心罢了。
若非如此，这些人也不会在后来猿飞日斩诈死复活后，对他冷眼旁观，宇智波断更不会放心让这些人继续保护纲手。
不过当下嘛
除了那个无论是年龄还是实力都不够资格的猿飞新之助被直接撸了，暗部只有总队长的职务发生了变化，原总队长而今是暗部的副总队长。
宇智波断直接毫不避讳地推荐了旗木朔茂担任暗部的总队长。
纲手自然毫不犹豫地同意了这一任命。
所以，现在的暗部总队长，变成了旗木朔茂。
负责辅助纲手进行暗部成员的筛选、训练、考核，以及任务安排等工作。
对于这样的任命，旗木朔茂受宠若惊的同时，也感觉压力山大。
因为这意味着纲手的安全将由他全权负责。
一旦出现任何的纰漏，连他自己都无法原谅自己。
不过在宇智波断表示会从旁协助后，旗木朔茂狠狠松了口气。
同时纲手还颁布了暗部忍者全新的筛选、训练、考核流程，使其更加的细致，也方便旗木朔茂更快地接手。
新官上任三把火，除了暗部，其他各个部门也需要