很快，随着魔祖黑莲当先逃离三界，三清他们也是很快去追杀。
魔祖虽然有些手段，最终因为石莫的掺和，并未能怎么挣扎，就被三清他们杀死了。
石莫一出手，三清他们也是发现石莫的实力手段竟不比老君和女娲差，惊叹的同时，也是对接下来和石莫一起去无尽混沌中闯荡的旅程更期待更有信心了起来。
三界中，石莫为外界所知的分身在本尊突破成为天道境后就去了混沌时空缝隙，进入了时空潮汐。
他留在三界的另外一个隐秘分身几乎没人知道。
随着天道境们的离开，混沌神魔一方的大道圆满存在也是蠢蠢欲动，最终在黑暗魔渊新的掌控者血海老祖和万魔之王波旬以及烛龙的召集下汇聚到黑暗魔渊，欲要联手逼道家佛门和天庭各方退让，好让他们能占据更多大世界，在三界更加无拘无束的去肆意杀戮吞吃。
如今三界中，秦云虽然执掌了碧游宫，但在血海老祖他们眼中是无法和石莫、后羿以及祖龙相比的。
石莫成了天道境，后羿也闭关了，祖龙就算再厉害也奈何不了联手的他们，所以魔道一方是信心十足，欲要一举占据三界中的更多大世界。
道家佛门和天庭也是联手开始行动，欲要将魔道一方赶回黑暗魔渊。
最终，道家佛门和天庭各方的大道圆满存在在祖龙和秦云的带领下直接杀入了波旬控制的六欲大世界中，一场双方最高层的决战开始了
波旬他们终究是小觑了秦云，待得秦云展露出了不逊于祖龙的实力后，接连斩杀多位大罪孽的混沌神魔大道圆满强者，就连波旬的主战本尊都死了。
唯一逃跑的烛龙，也是被最后现身的石莫给活捉收服
而后，石莫更是去了趟黑暗魔渊，收服了波旬还尚未恢复的弱小分身，并且通过心力神魂手段彻底灭杀了血海老祖。
石莫凭借超绝的手段折服了波旬，创下类似本命誓言的手段来约束波旬，并让他取代血海老祖掌控黑暗魔渊，为三界清理污秽
三界终于是恢复了平静，魔道一方幸存的大能受到了波旬的约束，侵入众多小世界的魔道天魔魔神们被召回，道魔战争结束了。
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