地球的行星意志们感受到新原初之影的威胁后，自发组成了“行星守护阵列”。冰川意志制造出能冻结时间与恐惧的绝对零度领域，雨林意志催生出蕴含万千生命希望的“永恒之树”，其根系深深扎入地脉，枝叶则向天空延伸，试图触碰新原初之影。海洋意志将整个太平洋化作巨大的意识之海，通过潮汐的涨落，向全地球传递着安抚与鼓励的波动。然而，新原初之影随意挥动手臂，便引发了全球性的超级海啸与极寒风暴，行星守护阵列在这股力量面前摇摇欲坠。
观测者遗族的旗舰在此时突然调转枪口，不再针对守衡盟，而是加入了对抗新原初之影的战斗。他们启动了隐藏的终极武器——“秩序之核”，这颗由整个文明数万年科技结晶打造的核心，能将周围的空间强行转化为绝对秩序的领域。但新原初之影仅仅是瞥了一眼，秩序之核便开始出现裂痕，暗金色的腐蚀纹路迅速蔓延，将秩序之核转化为增强其力量的工具。遗族领袖在旗舰即将被吞噬之际，将文明最后的记忆数据传输给守衡盟，其中包含了观测者文明在远古时期与原初之影第一次交锋的绝密档案。
守衡盟根据档案中的线索，发现新原初之影的核心并非单纯的恐惧集合体，而是创世代码自我修正机制的极端具象化。当宇宙中的可能性发展到失控边缘时，这个机制便会启动，试图将一切归零，重新开始。然而，由于之前与原初之影的战斗以及创世代码的重启，这个机制出现了严重的畸变，不再是温和的修正，而是变成了毁灭一切的疯狂。要阻止它，就必须深入其核心，重新编写修正机制的底层逻辑。
张楚岚带领着由各文明精英组成的敢死队，驾驶着经过混元胶质强化的星舰，朝着新原初之影的核心进发。途中，他们遭遇了由各种恐惧具象化而成的恐怖生物：能吞噬灵魂的虚无之影、将一切转化为混沌的熵增巨兽、让文明陷入永恒轮回的因果魔环。每突破一道防线，队员们的精神压力就增加一分，不少人开始出现幻觉，看到自己最害怕的场景在眼前上演。
唐文龙在后方利用熵寂平衡体与观测者遗族的科技，开发出“概念中和弹”。这种武器能暂时中和特定的恐惧概念，但需要精确计算投放时