一、华沙的最终陷落与屠城
9月27日中午，在德军持续17天的轰炸和封锁后，华沙守军被迫向德军第8军团司令布拉斯科维茨将军投降。这座曾经拥有130万人口的城市此时已沦为一片焦土：85的建筑被摧毁，维斯瓦河畔的老城区几乎被夷为平地，圣十字教堂的穹顶坍塌在废墟中，瓦砾下掩埋着无数平民的尸体。根据投降协议，波兰士兵放下武器后被允许保留军人荣誉，但14万被俘官兵中，约25万名军官在随后的“塔能堡行动”中被德军秘密处决。
投降后的华沙随即陷入德军的血腥报复。党卫军“骷髅师”进驻城市，对平民展开无差别屠杀。在普拉加区，德军将数百名居民驱赶到圣安妮教堂，然后用火焰喷射器点燃建筑；在犹太区，盖世太保挨家挨户搜捕青壮年，将他们送往马伊达内克集中营。至10月初，城内已有超过20万平民死亡，幸存者被强制佩戴蓝色臂章，在枪口下清理废墟。
二、德苏会师与波兰领土的瓜分
9月28日，德军与苏军在布列斯特-立陶夫斯克正式会师，双方士兵在城堡广场举行联合阅兵式，将波兰国旗换成纳粹党旗和苏联红旗。同一天，里宾特洛甫与莫洛托夫签署《苏德边界友好条约》，秘密划定了两国在波兰的势力范围：德国获得西波兰的波美拉尼亚、大波兰等工业核心区，苏联则吞并了包括利沃夫、维尔纽斯在内的东部领土，总人口约1300万的波兰东部地区被纳入苏联版图。
为执行这一划界，德军开始从波兰东部撤军。在利沃夫，苏军于9月22日接收城市后，立即违背投降协议，将波兰第10摩托化旅的1200名军官全部逮捕，其中大部分人在1940年的卡廷森林惨案中遇害。至10月6日，德苏完成对波兰全境的占领，两国军队沿布格河-桑河-维斯瓦河一线建立联合巡逻机制，波兰作为独立国家的历史暂时终结。
三、残余抵抗与流亡政府的挣扎
尽管华沙已陷，但波兰各地仍有零星抵抗。在克拉科夫南部山区，由瓦迪斯瓦夫·安德斯将军率领的第24