尉迟恭答道：太子与齐王作乱，秦王起兵诛之。因恐惊动陛下，故派臣入内警卫。
高祖闻言流泪，对裴寂等近臣说道：不料今竟出现此事！卿等以为如何？
裴寂未答，萧瑀及陈叔达奏道：建成与元吉本未参与举兵反隋大谋，又无甚战功，却嫉秦王功高，共同策划奸谋。今秦王讨诛，天下归心。陛下不如便立秦王为太子，并将国事委之，则天下太平。
高祖叹道：卿言甚善，此固我素来心愿。
于是便书敕令，交付尉迟敬德，命各军皆受秦王处置。天策府司马宇文士及自尉迟恭手中接过天子敕令，自东面登阁门以出，向玄武门众军宣布敕令，由是宫内安定。
高祖又遣黄门侍郎裴寂前往东宫，劝谕原李建成麾下将士，众军亦都弃职而散。
于是高祖命召秦王以入，抚慰道：朕近日昏愦，几生曾母投杼之惑，我儿休怪。
李世民跪倒在地，伏在高祖胸前，号啕大哭良久，不能止息。
画外音：玄武门之变中，东宫太子及齐王诸子大损。太子李建成诸子安陆王李承道、河东王李承德、武安王李承训、汝南王李承明、钜鹿王李承义；齐王李元吉诸子梁郡王李承业、渔阳王李承鸾、普安王李承奖、江夏王李承裕、义阳王李承度等，都被残忍杀害，并在宗室名册上除名。传说自此之后，李世民恐惧兄弟及其诸子鬼魂前来索命，即派尉迟恭与秦叔宝担任门前守卫。其后更命绘制两人画像挂在门口，成为后世门神由来。
当天下午申时，高祖颁下诏书，宣布大赦天下，叛逆罪名只加给李建成与李元吉二人，对其余部党羽，一概不加追究。朝中各项事务，任凭秦王处置。
次日，冯立与谢叔方自动入宫，叩阙负罪。薛万彻躲藏起来，李世民命其兄薛万钧寻而招之，薛万彻终出，自来投首。
李世民叹道：诸公都能忠于所奉之主，乃义士也。皆都赦免，官复原职。
唐高祖乃立秦王李世民为皇太子，并颁诏书：即日起，军国各项事务无论大小，全部委托太子处理决定，然后报朕可也。任命宇文士及为太子詹事，长孙无忌与杜如晦为左庶子，高士廉与房玄龄为右庶子，尉迟恭为左卫率，程知节为右卫率，秦叔宝为左武卫大将军，虞世南为中舍人，褚亮