赛季末，克罗斯遭遇肌肉撕裂伤病，进而缺席了欧冠决赛和德国杯决赛。2012-13赛季，克罗斯出场37次，打进9球助攻8次，帮助拜仁慕尼黑包揽德甲冠军、欧冠冠军和德国杯冠军，实现了三冠王伟业。
2013-14赛季，克罗斯出场51次，打进4球助攻9次，帮助球队夺得德甲冠军、德国杯冠军、欧洲超级杯冠军和世俱杯冠军。在欧冠赛场上，克罗斯出场12次，打进1球助攻2次，帮助球队杀进四强，并入围欧冠赛季最佳阵容。
2014年7月，克罗斯转会离开拜仁慕尼黑。在拜仁慕尼黑效力期间，克罗斯共计出场205次，打进24球助攻49次，帮助球队夺得1个欧冠冠军、3个德甲冠军、3个德国杯冠军、1个世俱杯冠军、1个欧洲超级杯冠军和2个德国超级杯冠军。
2014年7月17日，克罗斯加盟皇家马德里，转会费2500万欧元，外加500万欧元的浮动奖金；克罗斯与皇家马德里签订一份为期6年的合同，税后年薪600万欧元。2015年1月9日，欧足联公布2014年最佳阵容，克罗斯入选。2014-15赛季，克罗斯出场55次，打进2球助攻14次，并入选欧冠最佳阵容。
2015-16赛季，克罗斯代表皇家马德里出场44次，打进1球助攻13次，入围欧冠赛季最佳阵容。10月12日，克罗斯与皇家马德里续签一份到2022年6月30日的合同，合同违约金12亿欧元，他的年薪涨到2000万欧元，成为德国球员历史上的最高年薪。
2016-17赛季，克罗斯出场48次，打进4球助攻16次，跟随球队拿到西甲冠军、欧冠冠军、欧洲超级杯冠军和世俱杯冠军，并入围欧冠赛季最佳阵容以及欧足联评选的西甲赛季最佳阵容。
2017年，12月2日，国际足联2017年度最佳阵容揭晓，克罗斯入围。2017-18赛季，克罗斯出场43次，打进5球助攻10次，帮助球队夺得欧冠冠军、欧洲超级杯冠军、世俱杯冠军和西班牙超级杯冠军，同时入围欧冠赛季最佳阵容。
2018-19赛季，克罗斯出场43次，打进1球助攻6次。赛季结束后，克罗斯与皇家马德里续约至2023年6月30日。2019-20赛季