而苻坚在长安，南征的筹备也进入关键阶段。他大量征集粮草，为了确保粮草供应充足，专门设立了多个粮草征集点，分派官员负责督促，从全国各地征收粮食，并通过水陆联运的方式，囤积于各级据点。同时，他还下令打造战船，试图弥补水军短板。为了打造出坚固耐用且适应长江水域作战的战船，苻坚召集了国内最顶尖的工匠，日夜赶工。工匠们在船坞中忙碌，斧凿声、锤打声日夜不停，一艘艘战船逐渐成型。此外，苻坚又从各地选拔将领，充实军队指挥层，举行了多场军事考核和比武活动，选拔出那些武艺高强、谋略出众的将领。然而，随着筹备的深入，国内的经济压力逐渐显现，百姓赋税加重，开始出现些许怨言。一些百姓为了缴纳赋税，不得不节衣缩食，甚至变卖家中财物，生活变得愈发艰难。苻坚得知后，不得不分出精力，安抚民心。他派遣官员到各地安抚百姓，承诺战争结束后会减轻赋税，同时开仓放粮，救济那些生活困苦的百姓，以稳定国内局势。
慕容垂见苻坚国内矛盾渐起，心中大喜，觉得复国时机愈发成熟。他开始暗中联络一些在苻坚军中不得志的将领，这些将领因种种原因，如未得到应有的晋升、与上级关系不睦等，对苻坚心怀不满。慕容垂许以高官厚禄，劝其阵前倒戈。他秘密设宴，邀请这些将领到府上，在酒过三巡后，慕容垂言辞恳切地说道：“诸位将军，如今苻坚穷兵黩武，致使国内民怨沸腾，如此下去，大秦必不长久。我慕容氏乃燕国正统，若能恢复燕国，诸位将军皆为开国功臣，荣华富贵享之不尽。”这些将领有的心动犹豫，在利益的诱惑与对苻坚的忠诚之间摇摆不定；有的则直接将消息密报给了苻坚。苻坚听闻，大惊失色，意识到内部可能出现了严重的隐患，开始对军队进行清查。一时间，军中人心惶惶，士兵们不知道这场清