慈禧太后的灵柩与光绪帝梓宫（棺椁）先共同停放在乾清宫，灵堂布置得庄严肃穆，摆满了各种供品和挽联，营造出沉重的哀悼氛围。
供皇室宗亲、文武百官等前来吊唁。期间，每天都有复杂的祭祀仪式，包括上香、奠酒、读祭文等。
后又因礼制慈禧太后棺椁暂放宁寿殿。
因光绪帝先逝，按祖制“帝后同丧，先葬皇帝”，慈禧葬礼被迫推迟。
其棺椁后移至煤山（景山）停放，直至光绪下葬后才启动安葬程序。
但因光绪皇帝的崇陵迟迟未完工，慈禧太后的葬礼推迟一年后才下葬。
直到1909年11月9日才举行出殡仪式 ，慈禧太后才出殡，送葬队伍极为庞大，走在最前面的是仪仗队，有各种旗帜、幡幢等。
灵柩由众多杠夫抬着，杠夫们经过严格训练，以保证灵柩平稳。沿途有大量的士兵和警察维持秩序，道路两旁还有许多百姓围观。
送葬队伍达上万人，抬棺轿夫最多时128人， 队伍从北京紫禁城出发，前往东陵，整个行程耗时4天抵达清东陵普陀峪定东陵。
慈禧太后为了建造这座陵寝，慈禧太后不惜工本，陵寝内的装饰极尽奢华，无论是墙壁上的雕刻，还是棺椁的制作，都堪称巧夺天工。
到达东陵后，11月15日，棺椁入葬地宫，随葬珍宝价值连城（如夜明珠、翡翠白菜等）。
经过一系列的仪式，慈禧的灵柩被缓缓放入地宫。地宫内早已按照规制布置好，放置了许多随葬品。
待灵柩安置妥当后，工匠们封闭了地宫石门，完成了下葬仪式。
此后，守陵人员开始在陵区进行日常的守护和祭祀等工作。
但1928年，孙殿英盗掘定东陵以慈禧太后陵墓为主以及清东陵其他帝后陵墓。
慈禧遗体被抛尸棺外，珍宝洗劫一空。1983年，文物部门清理内棺时发现其遗体保存完好，身高约153米，经消毒后重新入殓。
时间上光绪虽先去世，但因陵墓未完工，下葬时间（1913年）晚于慈禧（1909年）。
慈禧太后葬礼因“先葬皇帝”的祖制被迫推迟一年。两人陵