随后，按照律法，李建成的儿子安陆王李承道、河东王李承德、武安王李承训、汝南王李承明、钜鹿王李承义，李元吉的儿子梁郡王李承业、渔阳王李承鸾、普安王李承奖、江夏王李承裕、义阳王李承度等人均伏诛，并除宗籍。一时之间，秦王府内腥风血雨，原本繁华的府邸此刻被一种压抑而又沉重的氛围所笼罩。
秦王府诸将领在胜利的喜悦与愤怒交织下，准备将李建成和李元吉的一百多名亲信全部诛杀，并将他们的家产没收官府。此时的秦王府，弥漫着一股浓烈的杀伐与掠夺的气息。
就在这时，李世积对李世民杀红了眼也有所不忍，他深知若将李建成与李元吉一派的亲信全部诛杀，必会留下恶名，不利于秦王日后治理天下。于是，他挺身而出，向李世民劝阻道：“罪孽都是两个元凶所犯，而他们已经伏诛了，倘若还要牵连他们的党羽，就不是谋求安定的做法了！以后您治理天下，还是需要那些人才的呀！” 李世民听后，仔细思索，便有所省悟。他意识到李世积所言极是，若此时大肆诛杀李建成与李元吉的亲信，极有可能引发更大的动荡与民怨。于是，李世民果断地命令诸将领停止了追杀。
当天，李渊颁布诏书赦天下，明确表示叛逆的罪名只加给李建成和李元吉二人，对其余的党羽，一概不加追究。僧人、尼姑和男女道士都应当依照原先颁布的诏令处理。国家的各项事务，都交由秦王处置。这道诏书犹如一颗定心丸，让原本惶恐不安的人心稍稍安定下来。
武德九年六月初五（626 年 7 月 3 日），冯立和谢叔方都自动出来负罪。他们深知自己的行为已经触犯了天威，也明白大势已去。薛万彻躲起来以后，李世民多次让人明示他，意思是只要他出来认罪，便不再追究其罪责。于是，薛万彻在权衡再三后，也无奈地走了出来。李世民看着眼前的这些人，感慨地说：“这些人都能够忠于自己所侍奉的人，是义士啊！便赦免了他们。” 他的这番话语，既展现了他的大度，也在一定程度上稳